Products

Wy hawwe koartlyn rapportearre dat pyrenenukleotide foarkar wurdt ynfoege tsjinoer in abasyske side, de 3'-T fan in thymine dimer, en de measte net-beskeadige basen troch gist DNA polymerase eta (pol eta).Omdat pyrene is in nonpolar molekule mei gjin H-bonding fermogen, de ûngewoan hege effisjinsjes fan dPMP ynfoegje wurde taskreaun oan syn superieure basis stacking fermogen, en ûnderstreekje it belang fan basis stacking yn de seleksje fan nucleotides troch pol eta.Om de rol te ûndersiikjen fan H-bonding en basepaar mjitkunde yn 'e seleksje fan nukleotiden troch pol eta, bepale wy de ynfoegje-effisjinsjes fan' e basis-modifisearre nukleotiden 2,6-diaminopurine, 2-aminopurine, 6-chloropurine, en inosine dy't soe meitsje in oar oantal H-obligaasjes mei de sjabloan basis ôfhinklik fan basis pear mjitkunde.Watson-Crick baseparing liket in wichtige rol te spyljen yn 'e seleksje fan nukleotide-analogen foar ynfoegje tsjinoer C en T, lykas bliken docht út de fermindering fan' e relative ynfoegje-effisjinsjes mei in ôfnimming fan it oantal Watson-Crick H-bindingen en in tanimming fan it oantal donor-donor en akseptor-akseptor ynteraksjes.De selektiviteit fan nukleotide-ynfoegje is grutter tsjinoer de 5'-T as de 3'-T fan 'e thymine-dimer, yn oerienstimming mei eardere wurken dy't suggerearje dat de 5'-T rigidiger wurdt hâlden as de 3'-T.Fierder liket it ynfoegjen fan A tsjin beide T's fan 'e dimer bemiddele te wurden troch Watson-Crick-baseparing en net troch Hoogsteen-baseparing basearre op 'e hast identike ynfoegje-effisjinsjes fan A en 7-deaza-A, wêrfan de lêste H- mist. bonding kapasiteit by N7.De relative effisjinsjes foar it ynfoegjen fan nukleotiden dy't Watson-Crick-basepearen kinne foarmje binne parallel oan dy foar it Klenow-fragmint, wylst it Klenow-fragmint sterker diskriminearret tsjin mismatches, yn oerienstimming mei syn gruttere foarmselektiviteit.Dizze resultaten ûnderstreekje it belang fan H-bonding en Watson-Crick basispear-geometry yn 'e seleksje fan nukleotiden troch sawol pol eta as it Klen ow-fragmint, en de mindere rol fan foarmseleksje by ynfoeging troch pol eta troch syn iepener en minder beheinde aktive side.